Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hace1Q3U0D9 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms