Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Mknk1-202ENSMUST00000106513 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Samd12Q0VE29 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms