Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
F13bQ07968 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms