Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Msx2Q03358 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms