Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Thbs2Q03350 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms