Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Top2aQ01320 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Top2aQ01320 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms