Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Col1a2Q01149 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Col1a2Q01149 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms