Protein–RNA interactions for Protein: Q00262

Stx2, Syntaxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx2Q00262 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Stx2Q00262 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms