Protein–RNA interactions for Protein: P83940

Eloc, Elongin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ElocP83940 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
ElocP83940 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
ElocP83940 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms