Protein–RNA interactions for Protein: P82350

Sgca, Alpha-sarcoglycan, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcaP82350 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SgcaP82350 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcaP82350 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
SgcaP82350 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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