Protein–RNA interactions for Protein: P70321

Hoxb13, Homeobox protein Hox-B13, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb13P70321 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
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Hoxb13P70321 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
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Hoxb13P70321 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxb13P70321 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms