Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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NcstnP57716 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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NcstnP57716 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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NcstnP57716 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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NcstnP57716 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NcstnP57716 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NcstnP57716 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms