Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Cldn18P56857 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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