Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CitP49025 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CitP49025 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CitP49025 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CitP49025 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CitP49025 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CitP49025 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CitP49025 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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CitP49025 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CitP49025 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CitP49025 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms