Protein–RNA interactions for Protein: P39688

Fyn, Tyrosine-protein kinase Fyn, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FynP39688 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
FynP39688 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FynP39688 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FynP39688 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FynP39688 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms