Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Tfap2aP34056 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Tfap2aP34056 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms