Protein–RNA interactions for Protein: P12246

Apcs, Serum amyloid P-component, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApcsP12246 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
ApcsP12246 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms