Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc4a1P04919 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc4a1P04919 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms