Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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H2-Ab1P01921 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
H2-Ab1P01921 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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H2-Ab1P01921 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2-Ab1P01921 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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