Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cops6O88545 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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