Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Kcns1O35173 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Kcns1O35173 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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