Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20878L7N244 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20878L7N244 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20878L7N244 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
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Gm20878L7N244 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Gm20878L7N244 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Gm20878L7N244 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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