Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms