Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Uhrf1bp1B2KF50 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms