Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm3550W4VSN7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm3550W4VSN7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm3550W4VSN7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms