Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Top3bQ9Z321 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Top3bQ9Z321 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Top3bQ9Z321 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Top3bQ9Z321 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms