Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E1

Mbd2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd2Q9Z2E1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd2Q9Z2E1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Mbd2Q9Z2E1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd2Q9Z2E1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Mbd2Q9Z2E1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Mbd2Q9Z2E1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Mbd2Q9Z2E1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms