Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N6

Sfrp4, Secreted frizzled-related sequence protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sfrp4Q9Z1N6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sfrp4Q9Z1N6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms