Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ddx39bQ9Z1N5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ddx39bQ9Z1N5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ddx39bQ9Z1N5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms