Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nek4Q9Z1J2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Nek4Q9Z1J2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nek4Q9Z1J2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.7 ms