Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Padi1Q9Z185 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Padi1Q9Z185 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms