Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cpne6Q9Z140 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cpne6Q9Z140 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cpne6Q9Z140 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms