Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Z3

Skp2, S-phase kinase-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp2Q9Z0Z3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skp2Q9Z0Z3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Skp2Q9Z0Z3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Skp2Q9Z0Z3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 181.7 ms