Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nr1h3Q9Z0Y9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nr1h3Q9Z0Y9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nr1h3Q9Z0Y9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms