Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L1

S1pr4, Sphingosine 1-phosphate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1pr4Q9Z0L1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
S1pr4Q9Z0L1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
S1pr4Q9Z0L1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
S1pr4Q9Z0L1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms