Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVJ9

Efemp2, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efemp2Q9WVJ9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Efemp2Q9WVJ9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Efemp2Q9WVJ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Efemp2Q9WVJ9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms