Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV89

Stxbp4, Syntaxin-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stxbp4Q9WV89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stxbp4Q9WV89 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Stxbp4Q9WV89 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Stxbp4Q9WV89 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1101.1 ms