Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Arpc1bQ9WV32 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Arpc1bQ9WV32 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arpc1bQ9WV32 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms