Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ5

Tnni1, Troponin I, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni1Q9WUZ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tnni1Q9WUZ5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnni1Q9WUZ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tnni1Q9WUZ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms