Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ggps1Q9WTN0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ggps1Q9WTN0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ggps1Q9WTN0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms