Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1Z8

Sorbs3, Vinexin, mousemouse

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sorbs3Q9R1Z8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sorbs3Q9R1Z8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sorbs3Q9R1Z8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sorbs3Q9R1Z8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms