Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prkab1Q9R078 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prkab1Q9R078 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prkab1Q9R078 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Prkab1Q9R078 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms