Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp11cQ9QZW0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp11cQ9QZW0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp11cQ9QZW0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp11cQ9QZW0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Atp11cQ9QZW0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp11cQ9QZW0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms