Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Npas3Q9QZQ0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Npas3Q9QZQ0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Npas3Q9QZQ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms