Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Copg1Q9QZE5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Copg1Q9QZE5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Copg1Q9QZE5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms