Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYS9

Qki, Protein quaking, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
QkiQ9QYS9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
QkiQ9QYS9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
QkiQ9QYS9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
QkiQ9QYS9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms