Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYR6

Map1a, Microtubule-associated protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 2,776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1aQ9QYR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Map1aQ9QYR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Map1aQ9QYR6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Map1aQ9QYR6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms