Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdzd4Q9QY39 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdzd4Q9QY39 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pdzd4Q9QY39 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms