Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC3

Dnaja4, DnaJ homolog subfamily A member 4, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaja4Q9JMC3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Dnaja4Q9JMC3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dnaja4Q9JMC3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dnaja4Q9JMC3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms