Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM62

Reep6, Receptor expression-enhancing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep6Q9JM62 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep6Q9JM62 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep6Q9JM62 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Reep6Q9JM62 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Reep6Q9JM62 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Reep6Q9JM62 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Reep6Q9JM62 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms